食品安全是當前公眾最為關心的問題之一，雖然我國已采取多項措施加強了對食品安全的監管，但食品安全事件仍時有發生。事實上，在問題的背后，除了監管體系依然不夠完善、少數不法廠商見利忘義等原因外，很可能還由于食品行業中存在一些深層次的矛盾尚未得到解決，從而使安全監管的難度加大。
第一、質量安全和數量安全的關系。食品的數量安全和質量安全在一定程度上存在著矛盾，即提高食品的質量往往要以降低產量為代價。農業生產技術以及食品加工技術的進步，大大提高了食品生產的效率并降低了生產成本。但是，食品生產技術的進步是一柄雙刃劍，若控制不當就會帶來質量安全問題。例如，種植業中濫用化肥和農藥，養殖業中濫用激素和抗生素，以及食品加工過程中使用各種有害的添加劑，等等。食品行業中生產擴張過快，很可能會威脅質量安全。因此，如果要同時提高食品的質量和產量，則必須在技術體系層面對食品生產進行徹底的改進，而這需要通過加大對農業和食品產業的投入才能實現。
第二、食品質量與食品價格的關系。長期以來，我國的食品價格穩定在一個較低的水平，雖然總體上對消費者是有利的，但也可能帶來食品質量低劣的問題，最終損害消費者的權益。
就如何改善食品質量，人們已提出了大量的建議，但一般都忽視了改善食品質量所產生的成本問題，仍希望在提高食品質量的同時保持低價格。但當價格低到一定程度時，食品生產者可能會陷入“遵循了質量標準就要虧損”的困局，事實上這正是一些廠商生產劣質食品甚至不惜摻入有害物質的初始動因。務實地來看，隨著食品質量的改善，其生產成本的提高是不可避免的，因此有必要在合理的范圍內允許提高食品的價格水平，同時，也需相應地提高人們的收入水平和消費能力。
食品生產加工企業分散、規模小，不利于建立完備的質量安全體系；在食品安全事件發生后，處罰問題廠商和保護產業發展之間可能會出現兩難。
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